Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Chd2E9PZM4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Chd2E9PZM4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd2E9PZM4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd2E9PZM4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms