Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zscan18E9PUD6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zscan18E9PUD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan18E9PUD6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan18E9PUD6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan18E9PUD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan18E9PUD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan18E9PUD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan18E9PUD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms