Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Piezo1E2JF22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Piezo1E2JF22 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms