Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035044E0CXF8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035044E0CXF8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC035044E0CXF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC035044E0CXF8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms