Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms