Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms