Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc8D3YZV8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc8D3YZV8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms