Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd1D3YXK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms