Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rexo5D3YW29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rexo5D3YW29 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms