Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia4B8QI36 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia4B8QI36 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms