Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usf3B2RUQ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms