Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan5bB2RTN3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms