Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol7aB2RT54 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apol7aB2RT54 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms