Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf1B2RRD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf1B2RRD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms