Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik3B1AS29 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms