Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm11569B1AQB1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm11569B1AQB1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm11569B1AQB1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm11569B1AQB1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm11569B1AQB1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm11569B1AQB1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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