Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skint2A7XUX6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms