Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor2A7M7C7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor2A7M7C7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor2A7M7C7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms