Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr16A3KMN5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr16A3KMN5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Prr16A3KMN5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr16A3KMN5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms