Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Upf2A2AT37 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Upf2A2AT37 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms