Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam205aA2APU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam205aA2APU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam205aA2APU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam205aA2APU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms