Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm12A2AJ77 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms