Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm11A2AGX3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm11A2AGX3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm11A2AGX3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm11A2AGX3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms