Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp8nlA2ABX0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms