Protein–RNA interactions for Protein: A2A8N0

Gm13084, Predicted gene 13084, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13084A2A8N0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm13084A2A8N0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm13084A2A8N0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm13084A2A8N0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms