Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprfA2A8L5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprfA2A8L5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprfA2A8L5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms