Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calcoco2A2A6M5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms