Protein–RNA interactions for Protein: A2A4F1

Rhox7a, Reproductive homeobox 7A, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox7aA2A4F1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhox7aA2A4F1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox7aA2A4F1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox7aA2A4F1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms