Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul4bA2A432 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms