Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUH6

Rbm8a2, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm8a2A0A0N4SUH6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms