Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms