Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms