Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms