Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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