Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28510A0A087WP28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28510A0A087WP28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28510A0A087WP28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28510A0A087WP28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms