Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Nek3Q9R0A5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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