Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms