Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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