Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms