Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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