Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Tspan4Q9DCK3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms