Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms