Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Snx5Q9D8U8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms