Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SlirpQ9D8T7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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