Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms