Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ccdc7Q9D541 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7Q9D541 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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