Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrameQ9D4Z5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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