Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms