Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gins3Q9CY94 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms