Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdhdQ9CXV1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SdhdQ9CXV1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms